בעיית המים קיימת במדינה מאז הקמתה, ישנם מספר מוגבל של מקורות מים בארץ שאותם יש לנצל בצורה הטובה ביותר. במשק המים הישראלי קיים ביקוש גבוהה להנדסאי טכנולוגיות מים שידעו לתפעל לתכנן ולתחזק מערכות סינון, התפלה ותובלה מתקדמות המורכבות מטכנולוגיות חדישות. לימודי הנדסאים בטכנולוגיות מים עונה על ביקוש זה ומכשיר הנדסאים מקצועיים ומיומנים לתחום. במסגרת הלימודים ילמדו הסטודנטים מגוון רחב של נושאי לימוד כגון: איכות מי שתייה, השקיה ושימוש במים מושבים, טכנולוגיות טיפול בשפכים, שאיבת מים, שיקום קרקעות מזוהמות, אוטומציה ובקרת תהליכים במערכות ועוד. תנאי הקבלה ללימודי הנדסאים בטכנולוגיות מים הם: תעודת בגרות מלאה או חלקית עם ציון חיובי באנגלית, מתמטיקה ברמה של לפחות 3 יחידות לימוד וציון חיובי בהבעה בעברית ברמה של 2 יחידות לימוד. מועמדים מעל גיל 35 בעלי 12 שנות לימוד יוכלו גם להתקבל למסלול הלימודים. משך הלימודים הוא כשנתיים כאשר בסופן מקבלים הבוגרים דיפלומת הנדסאי מים מטעם מה"ט.