תואר שני בליקויי למידה מיועד לאנשי חינוך או פסיכולוגיה שרוצים להתמקצע בתחום ליקויי הלמידה. ילדים בעלי צרכים מיוחדים וליקויי למידה מתקשים להשתלב במערכת החינוך ולהשתלב בתוכנית הלימודית הרגילה. תואר שני בליקויי למידה מעניק לסטודנטים ידע וכלים כיצד להעריך את יכולותיו ומגבלותיו של אותו תלמיד ולהתאים לו תוכנית לימודים המתאימה במיוחד לצרכיו המיוחדים. תוכנית הלימודים שונה בכל מוסד אך ברוב המקומות היא כוללת את התחומים הבאים: זיהוי ואיתור ליקויי למידה, טכניקות ודרכים לטיפול, מתודולוגיה מחקרית ועוד מגוון רב של נושאים. ברוב מוסדות הלימוד התואר נמשך כשנתיים כאשר בסופו זכאים הבוגרים לתואר M.Ed , תואר שני בליקויי למידה עם התמחות בהערכה והתערבות חינוכית. תנאי הקבלה לתואר דורשים: בעלי תואר ראשון עם ציון ממוצע של לפחות 85 בחינוך והוראה, חינוך מיוחד או פסיכולוגיה, בנוסף לכך נדרשים גם תעודת הוראה, מעבר ועדת קבלה וניסיון עיסוק של לפחות 3 שנים בתחום. בוגרי תואר שני בליקויי למידה יוכלו להשתלב במערכת החינוך הפורמאלית והבלתי פורמאלית במגוון תפקידי יעוץ וחינוך.